Repository of National Pirogov Memorial Medical University, Vinnytsia

Аналіз фенотипів та генетичних детермінант антибактеріальної резистентності Klebsiella pneumoniae, що спричиняють інфекційні ускладнення, пов’язані з наданням медичної допомоги у відділенні реанімації та інтенсивної терапії для хірургічних хворих

Show simple item record

dc.contributor.author Ганюк, В. М. uk
dc.contributor.author Хіль, В. Ю. uk
dc.contributor.author Кондратюк, В. М. uk
dc.contributor.author Францішко, А. А. uk
dc.contributor.author Поліщук, Л. М. uk
dc.date.accessioned 2022-11-11T09:01:10Z
dc.date.available 2022-11-11T09:01:10Z
dc.date.issued 2021
dc.identifier.citation Аналіз фенотипів та генетичних детермінант антибактеріальної резистентності Klebsiella pneumoniae, що спричиняють інфекційні ускладнення, пов’язані з наданням медичної допомоги у відділенні реанімації та інтенсивної терапії для хірургічних хворих / В. М. Ганюк, В. Ю. Хіль, В. М. Кондратюк [та ін.] // Сучасні аспекти військової медицини. Current Aspects of Military Medicine. – 2021. – № 28-1. – С. 152-163. uk_UA
dc.identifier.uri https://dspace.vnmu.edu.ua/123456789/5791
dc.description Purpose of the work: to study the phenotype of antibiotic resistance and the genetic mechanisms that conditioning it among isolates of Klebsiella pneumoniae in the intensive care unit (ICU). Materials and methods: local microbiological monitoring was carried out in the ICU (for surgical patients) if the National Military Medical Clinical Center «Main Military Clinical Hospital» during 2014–2020. For the study of genetic material by the next-generation sequencing method, 5 clinical isolates of Klebsiella pneumoniae were sent to the repository of multiresistant microorganisms of the Military Research Institute Walter Reed, USA. Results and discussion: the analysis included 631 results of microbiological research of clinical material from 88 patients, in whom 383 microorganisms were isolated. Klebsiella pneumoniae accounted for the largest share of 26.1% (100/383). Klebsiella pneumoniae appeared to be the dominant microorganism in blood culture – 24 isolates (26%). We found Klebsiella pneumoniae in 56 isolates urine cultures (21%) and 20 isolates (21%) in sputum, thus, making Klebsiella pneumoniae ranked second. The causative agents of Klebsiella pneumoniae have shown absolute resistance to aminopenicillins, third generation cephalosporins, protected cephalosporins, fluoroquinolones, gentamycin. Amikacin, phosphomycin, and the studied carbapenems were effective at around 30–40%. Tigecycline remained effective in more than 77% of the investigated isolates. The isolates were resistant to several classes of antibiotics at once. Genetic studies of 5 Klebsiella pneumoniae isolates have established the presence of 23 different resistance genes in their genome. Resistance to carbapenems was correlated found in four out of five isolates. One strain contained both the blaNDM-1 metal betalactamase and rmtC 16S methyltransferase. The isolates were assigned to three different sequence types by MLST. Conclusions: empiric antibiotic therapy regimens must necessarily include antibiotic combinations. The most effective is the combination of amikacin with carbapenems. The use of fosfomycin and tigecycline must be regulated to maintain the effectiveness of these drugs in the future. en
dc.description.abstract Мета роботи: вивчити фенотип стійкості до антибіотиків та генетичні механізми, які його зумовлюють, серед ізолятів Klebsiella pneumoniae відділення реанімації та інтенсивної терапії. Матеріали і методи. Локальний мікробіологічний моніторинг проведено у відділенні реанімації та інтенсивної терапії (для хірургічних хворих) Національного військово-медичного клінічного центру «Головний військовий клінічний госпіталь» (НВМКЦ «ГВКГ») протягом 2014–2020 рр. Для дослідження генетичного матеріалу методом секвенування нового покоління (next-generation sequencing) 5 клінічних ізолятів Klebsiella pneumoniae направлені до репозиторію полірезистентних мікроорганізмів Військового інституту досліджень ім. Волтера Ріда (США). Результати та їх обговорення. В аналіз включено 631 результат мікробіологічного дослідження клінічного матеріалу від 88 хворих, в яких виділено 383 мікроорганізми. Klebsiella pneumoniae склала найбільшу частку – 26,1% (100/383). Klebsiella pneumoniae виявилась домінуючим мікроорганізмом у гемокультурах – 24 ізоляти (26%). У посівах сечі 56 ізолятів (21%) та у мокроті 20 ізолятів (21%) Klebsiella pneumoniae посіли друге місце. Збудники Klebsiella pneumoniae виявили абсолютну стійкість до амінопеніцилінів, цефалоспоринів третього покоління, захищених цефалоспоринів, фторхінолонів, гентаміцину. Ефективними на рівні близько 30–40% були амікацин, фосфоміцин та досліджені карбапенеми. Тайгециклін зберігав ефективність до більше ніж 77% досліджених ізолятів. Ізоляти були стійкими одразу до кількох класів антибіотиків. Генетичні дослідження 5 ізолятів Klebsiella pneumoniae встановили наявність у їх геномі 23 різних генів резистентності. Стійкість до карбапенемів корелювала з наявністю blaOXA-48. Гени ESBL blaCTX-M-15, blaSHV, blaTEM виявлені у чотирьох з п'яти ізолятів. Один штам містив як метало-бета-лактамазу blaNDM-1, так ірізних sequence types. Висновки: схеми емпіричної антибактеріальної терапії хворих відділень реанімації та інтенсивної терапії обов’язково повинні включати комбінації антибіотиків. Найефективнішим є поєднання амікацину з карбапенемами. Застосування фосфоміцину та тайгецикліну необхідно регулювати для збереження ефективності цих препаратів на майбутнє. uk_UA
dc.language.iso uk_UA_ uk_UA
dc.subject бактерії uk_UA
dc.subject секвенування цілого геному uk_UA
dc.subject фенотип uk_UA
dc.subject множинна стійкість uk_UA
dc.subject стійкість до антибіотиків uk_UA
dc.subject внутрішньолікарняна інфекція uk_UA
dc.subject Klebsiella pneumoniae
dc.title Аналіз фенотипів та генетичних детермінант антибактеріальної резистентності Klebsiella pneumoniae, що спричиняють інфекційні ускладнення, пов’язані з наданням медичної допомоги у відділенні реанімації та інтенсивної терапії для хірургічних хворих uk_UA
dc.title.alternative Analysis of phenotypes and genetic determinants of the antibacterial resistance of Klebsiella pneumoniae, which causes infectious complications associated with the provision of medical care in the intensive care unit for surgical patients en
dc.type Article en


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Browse

My Account

Statistics