Кафедра мікробіології
https://dspace.vnmu.edu.ua/123456789/36
2024-03-28T18:07:48ZMolecular epidemiology and antibiotic resistance of pseudomonas aeruginosa isolates from war casualties in Ukraine
https://dspace.vnmu.edu.ua/123456789/6501
Molecular epidemiology and antibiotic resistance of pseudomonas aeruginosa isolates from war casualties in Ukraine
Kondratiuk, V; Kovalenko, I; Mc Gann, P; Lebreton, F; Jones, B
Background Pseudomonas aeruginosa (Pa) continues to be a major cause of morbidity, affecting combat casualties. The increasing infection rate across evacuation echelons of care can result in the international spread of multi-drug resistant (MDR) strains [1]. Novel data about sequence types harboring antibiotic resistance (AbR) genes, and identifying consistent patterns of Pa transmission, can help restrict global spread.
2023-01-01T00:00:00ZВивчення впливу окремих компонент у середовищі культивування на біоплівкоутворювальну активність P. aeruginosa та A. baumannii
https://dspace.vnmu.edu.ua/123456789/6186
Вивчення впливу окремих компонент у середовищі культивування на біоплівкоутворювальну активність P. aeruginosa та A. baumannii
Ковальчук, В. П.; Буркот, В. М.; Дудар, А. О.; Кондратюк, В. М.; Жорняк, О. І.; Прокопчук, З. М.; Трофіменко, Ю. Ю.
Мікроорганізми P. aeruginosa, A. baumannii часто стають збудниками важких ранових інфекцій, вентилятор-асоційованих пневмоній, катетер-асоційованих септичних станів та інших важких патологічних процесів. У патогенезі цих захворювань важливу роль відіграє здатність бактерій до біоплівкоутворення в уражених тканинах. Тому метою нашої роботи є дослідження впливу окремих зовнішніх чинників на здатність бактерій до утворення біоплівок. У процесі проведених досліджень використано 5 клінічних штамів P. аeruginosa та 5 штамів A. baumannii. Здатність до утворення біоплівок вивчали у 96-лункових полістиролових планшетах спектрофотометричним методом, який ґрунтується на здатності барвника кристалічного фіолетового зв'язуватись із клітинами та матриксом біоплівки. Статистична обробка отриманих результатів проведена з використанням таблиць Excel Microcoft Office. Досліджено вплив на процеси біоплівкоутворення псевдомонадами та ацінетобактеріями в присутності у середовищі культивування окремих цукрів та азотвмісних сполук. У результаті проведених досліджень було встановлено, що ацінетобактерії проявляють здатність до утворення плівок, на відміну від псевдомонад, при умові їх культивування у стерильній дистильованій воді. Внесення до середовища культивування окремих вуглеводів чи сечовини інтенсифікувало біоплівкоутворювальні властивості псевдомонад значно більшою мірою, порівняно з ацінетобактеріями. За результатами досліджень встановлено, що найбільш активно процес біоплівкоутворення відбувається в обох видів неферментуючих грамнегативних бактерій при наявності у середовищі культивування білків сироватки крові тварин. Утворення біоплівок - одна з основних стратегій, що підвищує виживання бактерій у навколишньому середовищі, а також в організмі людини. Здатність бактерій формувати біоплівки, крім іншого, є чинником патогенності та вірулентності бактерій. Тому, в останні роки, особлива увага приділяється як здатності мікроорганізмів утворювати біоплівки, так і вивченню факторів, що впливають на зазначений процес.
2023-01-01T00:00:00ZЗастосування сучасних новітніх методик навчання в освітньому процесі у ВНМУ ім. М. І. Пирогова
https://dspace.vnmu.edu.ua/123456789/6185
Застосування сучасних новітніх методик навчання в освітньому процесі у ВНМУ ім. М. І. Пирогова
Буркот, В. М.; Дудар, А. О.; Кондратюк, В. М.; Жорняк, О. І.; Осадчук, Н. І.
2023-01-01T00:00:00ZPhenotypic and genotypic characterization of antibiotic resistance in military hospital-associated bacteria from war injuries in the Eastern Ukraine conflict between 2014 and 2020
https://dspace.vnmu.edu.ua/123456789/5792
Phenotypic and genotypic characterization of antibiotic resistance in military hospital-associated bacteria from war injuries in the Eastern Ukraine conflict between 2014 and 2020
Kondratiuk, V.; Jones, B. T.; Kovalchuk, V.; Kovalenko, I.; Ganiuk, V.; Kondratiuk, O.; Frantsishko, A.
Background: Infections from the recent conflict in Ukraine have been poorly investigated. Aim: To describe the phenotypic and genotypic mechanisms of antibiotic resistance in pathogens associated with war injuries in the Ukraine conflict. Methods: This report describes a retrospective multi-centre microbiological survey conducted in four Ukrainian military hospitals between 2014 and 2020. The phenotypes of 813 organisms obtained from 1061 tests of 162 patients were analysed. Fifty-two isolates underwent whole-genome sequencing. Findings: Resistance was highest in Acinetobacter baumannii, with 92.5% ((48/52) 95% confidence interval (CI) 81.8e97.9) resistant to fluoroquinolones, 83.0% ((43/52) 95% CI 70.2e91.9) resistant to aminoglycosides, and 67.9% ((37/52) 95% CI 53.7e80.1) resistant to carbapenems. In contrast, resistance to carbapenems was 55.6% ((30/52) 95% CI 41.4 e69.1) in Pseudomonas aeruginosa, 42.9% in Escherichia coli ((12/28) 95% CI 24.5e62.8), and 32.8% in Klebsiella pneumoniae ((20/34) 95% CI 21.3e46.0). Multi-drug-resistant strains harboured an abundance of antibiotic resistance genes. K. pneumoniae coproduced class A and D b-lactamases, in one case with blaNDM-1 and rmtC 16S rRNA methyltransferase. A. baumannii carried class A and D b-lactamases but not metallo-blactamases; in four isolates, carbapenemases were present with the RmtASE gene arm A. P. aeruginosa harboured a wide range of class A and D b-lactamases along with metallo-b- lactamases, as well as the RmtB4 RmtASE gene. Gram-positive cocci were generally sensitive to the tested antibiotics. Conclusion: The incidence of resistance among the studied pathogens was higher than that in Ukrainian civilian hospitals and European countries. The discovery of P. aeruginosa, A. baumannii, and K. pneumoniae co-producing carbapenemases and RmtASEs is of particular importance, and hospitals should be vigilant for their emergence.
Corresponding author. National Pirogov Memorial Medical University,
Pyrohova St, 56, Vinnytsia, 21018, Ukraine.
E-mail address: kondratuk.slava@vnmu.edu.ua (V. Kondratiuk).
Available online at www.sciencedirect.com Journal of Hospital Infection journal homepage: www.elsevier.com/locate/jhin https://doi.org/10.1016/j.jhin.2021.03.020
2021-01-01T00:00:00Z